自清洗Y型过滤器清洗过程不需要用户的任何操作，便可自动的完成清洗，当Y型过滤器的压差达到预设值时，将开始自动清洗过程，此间净水供应不断流，清洗阀打开，清洗室及吸污器内水压大幅度下降，通过滤筒与吸污管的压力差，吸污管与清洗室之间通过吸嘴产生一个吸力，形成一个吸污过程。同时，电力马达带动吸污管沿轴向做螺旋运动。吸污器轴向运动与旋转运动的结合将整个滤网内表面清洗干净。整个冲洗过程只需数十秒钟。排污阀在清洗结束时关闭，Y型过滤器开始准备下一个清洗。自清洗过滤器清洗时需格外注意以下几点：

1. 当Y型过滤器处于工作时，不能进行清洗，一面造成事故或损坏。

2. 在进行清洗时，水中应不含腐蚀型介质或含铁离子浓度要低。

3. 如果用蒸汽作为杀菌介质，处理腈垫片的蒸汽温度不要超过132℃、处理三元乙丙橡胶垫片的蒸汽温度不要超过177℃。